教程共185篇 第9页
Linux命令之cd使用心得
科研狗必备技能 前面27节，我们已经通过气相分子的例子，带领大家顺利度过了菜鸟这一关。如果你掌握了其中的思想，勤加操练，看官网，认真阅读看大师兄推荐的参考书，相信你的能力足以...
Zero10月前Ex27 乙醇分子的振动频率计算(五)
通过前面读者的反馈，本节前面主要讲述一下零点能相关的注意事项以及频率计算的时间成本相关的知识。 1 参考书籍： 以下所提到的书籍都可以在QQ群文件和百度网盘里面下载：h...
Zero10月前Ex26 乙醇分子的振动频率计算(四)
前面我们学会了通过使用 Jmol 查看分子振动。但分子振动频率在OUTCAR是什么样子的呢？今天我们就分析一下OUTCAR文件中的频率信息，以及如何写脚本计算零...
Zero10月前Ex25 乙醇分子的振动频率计算(三)
本节推荐一款可视化程序：Jmol，可以用来看分子结构以及振动频率。Jmol 是一款Java语言编写的，开源，Linux，Windows均可的使用的可视化软件。还记的我们从...
Zero10月前Ex23 乙醇分子的振动频率计算(一)
大师兄在本节开头放上这张图片的意思是，请大家再仔细体会Rubbish in， Rubbish out这句话，只有对我们要研究的体系有一定的理解，明白我们具体要计算什么内容，设置好输...
Zero10月前Ex24 乙醇分子的振动频率计算(二)
按照前面一节介绍的方法，结构优化过程完毕后，准备频率计算的输入文件，提交任务等待结束。然后我们介绍一下频率计算的输出与POSCAR原子的固定。 1 查看结果 1.1 查...
Zero10月前Ex22 乙醇气相分子的优化
前面我们终于讲完了 O2 分子优化的例子。相信大家对 VASP 计算已经有了一个初步的理解。这一节我们继续学习气相分子的优化。为了让大家进一步了解计算的过程，我们选取一个稍微复杂的...
Zero10月前Ex20 谁偷走的我的机时？（五）
并行 前面几节讨论的都是一些涉及到模型以及计算细节对时间的影响。本节我们讨论一下服务器节点设置（并行）的影响。从字面上不难理解，并行就是多个节点同时计算同一个任务。好...
Zero10月前Ex19 谁偷走的我的机时？（四）
模型对计算时间的影响 上一节介绍的KPOINTS对计算的影响，相信大家已经认真阅读参考书的第三章部分了。本季我们讨论一下模型的大小对计算的影响。主要体现在晶胞的尺寸，...
Zero10月前Ex18 谁偷走的我的机时？（三）
KPOINTS对计算时间的影响 继续前面的学习，本节讨论KPOINTS文件中K点的设置对计算时间的影响。本节图中的Linux命令不再详细介绍，大师兄默认大家已经基本掌...
Zero10月前Ex17 谁偷走的我的机时？（二）
这一节和后面几节，我们会复习一下前面学到的Linux批量操作知识，然后对一些影响计算时间的参数进行测试。 本节主要考虑ENCUT的影响。前面我们一直在说EDIFF和EDIFFG对计...
Zero10月前Ex16 谁偷走的我的机时？（一）
前面O2初始结构为0.9 \AA时，如果使用BRION=2，相对于初始结构为1.07\AA的时候，为避免过度矫正，我们需要设置一个更小的POTIM，大师兄尝试过了，POTIM = ...
Zero10月前