ASE消虚频的小脚本
ASE消虚频的小脚本 做计算，虚频是令我们又爱又恨的一个东西。结构优化的时候，出现虚频，往往需要我们花费大量的时间和精力去消掉它们，最后搞得精疲力尽。算过渡态的时候，它又不出...
Zero8月前通过ASE获取原子之间的距离
通过ASE获取原子之间的距离 原子之间的距离是计算化学中模型搭建，结果分析中经常需要分析的部分。而计算原子的之间的距离也非常简单，通过可视化软件直接点两个原子就可以直接显示出...
Zero8月前Ipad 连接服务器APP
在ipad，手机上运行终端，连接服务器可以让我们随时随地查看，提交任务。在这里推荐一款ipad和iphone上的终端APP: SSHaking。如果你用的安卓系统，一些推荐的APP...
Zero8月前从Citrine Informatics数据库获取数据
Citrine 也是一个材料学数据库，自带了机器学习工具，大家也可以研究琢磨一下。官网是 https://citrination.com/search/simple?se...
Zero8月前利用matminer从数据库获取数据
https://nbviewer.jupyter.org/github/hackingmaterials/matminer_examples/blob/master/matmine...
Zero8月前超好用的材料类机器学习开源软件-Matminer
今天向大家隆重介绍一款材料类的机器学习开源软件：Matminer！机器学习预测材料性质，乃至逆向设计材料是材料领域的热门研究话题。很多同学有心做机器学习方面的研究，奈何不知道有哪些...
Zero8月前离子迁移概率密度可视化
大师兄在9月8日的文章中讲了如何用 Pymatgen 计算离子的电导率（该方法可以用来研究固态电解质等问题），本次，大师兄介绍一下如何使用 Pymatgen 可视化离子的迁移概率密...
Zero8月前Ubuntu常用软件的安装
前面一节我们介绍了Ubuntu虚拟机的安装，今天就介绍一些Ubuntu常用软件的软装。大部分极其简单，敲个命令，输入下密码就能解决。少部分非常简单，设置下环境变量就可以解决。有些安...
Zero8月前Ubuntu虚拟机的安装
为方便新手入坑，这里我们先介绍一下Ubuntu虚拟机的安装细节。VMWARE和VirtualBox是两个主要的选择，前者收费，后者免费。当然介绍免费的喽。 本节主要把安装的过程展示...
Zero8月前Ubuntu20中P4VASP的安装
P4vasp是一款基于Python2的，用于可视化，搭建结构的软件。由于Python2已经被时代所淘汰，p4vasp官网也不见任何的针对python3的更新改进，这个软件估计要凉，...
Zero8月前ASE的骚操作系列（SMILES-To-XYZ）
今天我们介绍ASE的另一个骚操作：结合Openbabel自动搭分子结构。与其说是ASE的骚操作，不如把这个骚字放在Openbabel头上。Openbabel是一款功能极其强大的结构...
Zero8月前ASE的骚操作系列（扩胞）
本节介绍一下ASE的另一个骚操作—-扩胞。说到扩胞，这个大家都不陌生，可以有很多种方式来实现，本教程中就介绍了p4vasp的一种操作，今天就看一下ASE的骚操作吧。废话不多说，直接...
Zero8月前