Ex76 过渡态任务的检查（一）
前面我们介绍了怎么准备过渡态计算的INCAR，POSCAR，POTCAR和POTCAR，这一节理所当然，就是要提交任务了。过渡态计算的时候，和大多数的计算是一样的：检查输入文件，准...
Zero9月前Ex75 过渡态的计算（六）
过渡态计算INCAR的设置 vasp的过渡态任务所需要的五个文件：INCAR, KPOINTS, POSCAR, POTCAR以及脚本。我们已经学习了三个，还差INCAR和脚...
Zero9月前Ex74 过渡态的计算（五）
前面2节我们讲了如何通过vtst的脚本进行插点,得到过渡态计算中特定数目的images，以及一个非常实用的小脚本来固定slab模型中底层的原子。本节我们就准备一下过渡态计算中：PO...
Zero9月前Ex73 过渡态的计算（四）
在学习下面neb的计算前，思考了很久，感觉有必要先给大家介绍一个非常实用的python小脚本，经历过反复的修改，最终在群友小塔玛斯的努力下，完成了一个稳定的过渡态计算中非常实用小脚...
Zero9月前Ex72 过渡态的计算（三）
不好意思，让大家久等了。最近一直很忙，后面还是会很忙。为了不让大家失望，抽时间把简单的过渡态计算讲解一下，这一节我们需要学习的是通过CI-NEB（Climbing Image Nu...
Zero9月前Ex71 过渡态的计算（二）
前面一节我们讲了直接优化NH3翻转的过渡态。这一节我们继续直接优化过渡态的介绍。计算乙烷分子（CH3CH3）绕C—C键旋转的过渡态。我们知道：乙烷有交错式和重叠式构型。而重叠式能量...
Zero9月前Ex70 过渡态的计算（一）
从本节起，我们开始学习下过渡态相关的计算。在进行下面的讲解之前，大家务必要记住这两点： 1） 过渡态只是一个结构而已，过渡态的计算并不是你想象的那么神秘；也就是计算很容易。...
Zero9月前Ex69 表面吸附物种的熵
上一节我们知道怎么获取气相分子的熵以及吉布斯自由能的计算。这一节，我们简单介绍一下表面吸附分子熵的计算。 复习基础知识 首先我们应该要知道对一个体系来说，都有哪几部分对...
Zero9月前Ex68 频率，零点能，吉布斯自由能的计算
前面几节，我们讲解完成了表面上吸附的计算细节。学习到现在，表面吸附的具体流程，如何简化计算，如何判断优化的结构正确与否，这些都是你应该掌握，并且时刻保持思考的事情。尤其是计算存在N...
Zero9月前Ex67 H2O在Cu(111)表面上的吸附能
前面我们搭建了十二个H2O的初始吸附构型。为了获取最稳定的结构，我们需要将这些可能的结构都优化一遍，然后通过吸附能来判断。但是这12个结构，我们都要优化的话，需要很多的机时，尤其是...
Zero9月前Ex66 H2O在Cu(111)表面上的吸附模型
结合上一节的内容，下面主要讲解一下H2O分子在Cu(111)表面吸附的初始模型搭建。 1. 计算H2O气相分子的能量 相信大家已经轻车熟路了（老司机）。只将INCAR，...
Zero9月前Ex65 p4vasp 的旋转操作
经过前面的学习，相信对于：单原子和双原子分子的吸附，大家已经掌握了怎么搭建模型，以及计算吸附能了。下一节我们要讲的是三原子分子的吸附。在进行三原子分子吸附的计算之前，我想是时候祭出...
Zero9月前